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Table 8 Means (SD) of LSE for three one-locus models (4), (5) and (6) when m = 3.

From: On coding genotypes for genetic markers with multiple alleles in genetic association study of quantitative traits

Allele

μ

α 1

α 2

δ 11

δ 22

δ 12

σ 2

True

42

-6

4

-20

0

-10

 

D = 0, σ2 = 0

42.0(0.00)

-6.00(0.00)

4.00(0.00)

-20.00(0.00)

0.00(0.00)

-10.00(0.00)

0.00(0.00)

D = 0, σ2 = 288

41.99(1.07)

-5.98(1.61)

3.99(1.44)

-20.06(3.80)

0.02(2.85)

-9.98(2.42)

287.84(12.91)

D = 0.02, σ2 = 0

42.00(0.00)

-6.00(0.00)

4.00(0.00)

-20.00(0.00)

0.00(0.00)

-10.00(0.00)

0.00(0.00)

D = 0.02, σ2 = 288

41.98(1.14)

-5.97(1.60)

4.01(1.46)

-20.07(6.21)

0.03(3.09)

-10.04(2.31)

287.81(12.91)

 

G 11

G 22

G 33

G 12

G 13

G 23

 
 

10

50

42

30

36

46

 
 

10.00(0.00)

50.00(0.00)

42.00(0.00)

30.00(0.00)

36.00(0.00)

46.00(0.00)

 
 

9.96(2.73)

49.99(1.79)

41.99(1.07)

30.02(1.55)

36.01(1.20)

45.98(0.98)

 
 

10.00(0.00)

50.00(0.00)

42.00(0.00)

30.00(0.00)

36.00(0.00)

46.00(0.00)

 
 

9.96(5.66)

50.03(2.21)

41.98(1.14)

29.97(1.38)

36.01(1.12)

45.99(0.93)

 

F

τ

a 1

a 2

d 11

d 22

d 12

σ 2

True

30

-16

4

10

0

-10

 

D = 0, σ2 = 0

30.00(0.00)

-16.00(0.00)

4.00(0.00)

10.00(0.00)

0.00(0.00)

-10.00(0.00)

0.00(0.00)

D = 0, σ2 = 288

29.98(1.64)

-16.01(1.46)

4.00(1.05)

10.03(1.90)

-0.01(1.42)

-9.98(2.42)

287.84(12.91)

D = 0.02, σ2 = 0

30.00(0.00)

-16.00(0.00)

4.00(0.00)

10.00(0.00)

0.00(0.00)

-10.00(0.00)

0.00(0.00)

D = 0.02, σ2 = 288

29.99(3.05)

-16.01(2.88)

4.03(1.25)

10.04(3.10)

-0.01(1.54)

-10.04(2.31)

287.81(12.91)

 

G 11

G 22

G 33

G 12

G 13

G 23

 
 

10

50

42

30

36

46

 
 

10.00(0.00)

50.00(0.00)

42.00(0.00)

30.00(0.00)

36.00(0.00)

46.00(0.00)

 
 

9.96(2.73)

49.99(1.79)

41.99(1.07)

30.02(1.55)

36.01(1.20)

45.98(0.98)

 
 

10.00(0.00)

50.00(0.00)

42.00(0.00)

30.00(0.00)

36.00(0.00)

46.00(0.00)

 
 

9.96(5.66)

50.03(2.21)

41.98(1.14)

29.97(1.38)

36.01(1.12)

45.99(0.93)

 

Allele-count

π 0

π 1

π 2

η 11

η 22

η 12

σ 2

True

42

-6

4

-32

8

-10

 

D = 0, σ2 = 0

42.00(0.00)

-6.00(0.00)

4.00(0.00)

-32.00(0.00)

8.00(0.00)

-10.00(0.00)

0.00(0.00)

D = 0, σ2 = 288

41.99(1.07)

-5.98(1.61)

3.99(1.44)

-32.03(2.92)

8.00(2.09)

-9.98(2.42)

287.84(12.91)

D = 0.02, σ2 = 0

42.00(0.00)

-6.00(0.00)

4.00(0.00)

-32.00(0.00)

8.00(0.00)

-10.00(0.00)

0.00(0.00)

D = 0.02, σ2 = 288

41.98(1.14)

-5.97(1.60)

4.01(1.46)

-32.02(5.76)

8.05(2.51)

-10.04(2.31)

287.81(12.91)

 

G 11

G 22

G 33

G 12

G 13

G 23

 
 

10

50

42

30

36

46

 
 

10.00(0.00)

50.00(0.00)

42.00(0.00)

30.00(0.00)

36.00(0.00)

46.00(0.00)

 
 

9.96(2.73)

49.99(1.79)

41.99(1.07)

30.02(1.55)

36.01(1.20)

45.98(0.98)

 
 

10.00(0.00)

50.00(0.00)

42.00(0.00)

30.00(0.00)

36.00(0.00)

46.00(0.00)

 
 

9.96(5.66)

50.03(2.21)

41.98(1.14)

29.97(1.38)

36.01(1.12)

45.99(0.93)