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Table 1 Number of e-PCR amplicons and corresponding homologous colinear loci in B. rapa (A genome) and B. oleracea (C genome) for B. napus linkage groups

From: Identification of candidate genes of QTLs for seed weight in Brassica napus through comparative mapping among Arabidopsis and Brassicaspecies

B. napus B. rapa B. oleracea
LG SSR loci Amplicons in B. rapaand B. oleracea Chr Homologous colinear loci Chr Homologous colinear loci
A1 19 35 A1 14 C1 13
A2 35 82 A2 18 C2 11
A3 39 71 A3 30 C3 15
      C6 7
A4 13 27 A4 9 C4 5
A5 24 69 A5 12 C5 4
    A6 6   
A6 16 73 A6 13 C5 4
      C6 7
A7 22 31 A7 10 C7 4
A8 10 23 A8 7 C3 3
      C8 3
A9 5 13 A4 3 C4 3
A10 16 40 A10 12 C9 9
Subtotal 199 464   134   88
C1 24 69 A1 10 C1 13
C2 17 46 A2 11 C2 9
C3 39 67 A3 18 C3 23
C4 21 75 A4 2 C4 8
C5 21 45 A1 3 C5 4
    A6 6 C6 5
C6 13 42 A7 3 C7 9
C7 16 39 A7 3 C6 10
C8 19 46 A9 11 C8 14
C9 28 52 A9 22 C3 3
      C8 12
Subtotal 198 481   89   110
Total 397 945   223   198