Genome-wide analysis of zygotic linkage disequilibrium and its components in crossbred cattle

BMC Genomic Data

Table 3 **The power estimates* of test statistics for the trigenic and quadrigenic disequilibria for marker pairs with a distance ≤50 Mb and >50 Mb on 29 autosomes in the Kinsella composite beef population**

BTA	$X_{D_{ABB}}^{2}$		$X_{D_{AAB}}^{2}$		$X_{Δ_{ABAB}}^{2}$
BTA	≤50 Mb	>50 Mb	≤50 Mb	>50 Mb	≤50 Mb	>50 Mb
1	0.124	0.122	0.120	0.108	0.076	0.052
2	0.140	0.130	0.140	0.134	0.077	0.054
3	0.119	0.113	0.120	0.115	0.076	0.053
4	0.119	0.119	0.117	0.115	0.082	0.055
5	0.131	0.126	0.133	0.124	0.079	0.053
6	0.124	0.120	0.121	0.108	0.079	0.052
7	0.114	0.114	0.115	0.121	0.078	0.056
8	0.122	0.119	0.119	0.114	0.081	0.056
9	0.128	0.119	0.135	0.140	0.072	0.053
10	0.129	0.126	0.126	0.118	0.082	0.055
11	0.132	0.126	0.131	0.129	0.078	0.053
12	0.128	0.120	0.125	0.118	0.076	0.053
13	0.122	0.127	0.122	0.117	0.082	0.055
14	0.120	0.113	0.126	0.122	0.084	0.053
15	0.128	0.137	0.127	0.138	0.075	0.056
16	0.135	0.097	0.135	0.120	0.073	0.053
17	0.103	0.111	0.112	0.134	0.076	0.052
18	0.145	0.165	0.131	0.138	0.078	0.055
19	0.126	0.178	0.117	0.116	0.078	0.053
20	0.134	0.126	0.136	0.133	0.077	0.055
21	0.127	0.116	0.117	0.092	0.072	0.052
22	0.114	0.081	0.127	0.148	0.079	0.055
23	0.141	0.184	0.129	0.117	0.08	0.059
24	0.139	0.116	0.145	0.137	0.083	0.055
25	0.145	-^a	0.142	-	0.092	-
26	0.115	0.000^b	0.110	0.000	0.077	0.000
27	0.12	-	0.126	-	0.078	-
28	0.122	-	0.138	-	0.077	-
29	0.141	0.121	0.125	0.107	0.077	0.066
Overall	0.130	0.125	0.130	0.123	0.080	0.055

* Proportion of marker pairs that X² exceeded 3.84, the 5% critical value of $χ_{(1)}^{2}$ .
^a The chromosome length was shorter than 50 Mb and there were no marker pairs with a distance that would exceed 50 Mb.
^b Chromosome 26 was 52 Mb long but no marker pairs with a distance of >50 Mb had a chi-square statistic that exceeded 3.84.

ISSN: 2730-6844