Table 3 Regions significantly associated with fatty acids of the summer milk samples and the percentage of the total additive genetic variance explained by the most significant SNP in that region
From: Genomic regions associated with bovine milk fatty acids in both summer and winter milk samples
Region1 | Start | End | Trait | #Traits/ | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
(Mbp) | (Mbp) | C4:0 | C6:0 | C8:0 | C10:0 | C12:0 | C14:0 | C16:0 | C18:0 | C10:1 | C12:1 | C14:1 | C16:1 | C18:1 | CLA | region | |
1a | 105.1 | 106.3 | 3.3 | 1 | |||||||||||||
1b | 153.5 | 154.8 | 2.5 | 1 | |||||||||||||
2a | 56.3 | 69.5 | 4.0 | 1 | |||||||||||||
2b | 106.2 | 113.9 | 5.0 | 1 | |||||||||||||
2c | 118.9 | 118.9 | 3.0 | 1 | |||||||||||||
3 | 72.6 | 72.6 | 3.5 | 1 | |||||||||||||
4a | 60.0 | 60.0 | 2.8 | 1 | |||||||||||||
4b | 121.8 | 123.7 | 3.2 | 1 | |||||||||||||
5a | 9.1 | 12.5 | 4.0 | 1 | |||||||||||||
5b | 36.0 | 36.1 | 3.4 | 1 | |||||||||||||
5c | 96.3 | 108.8 | 5.3 | 4.9 | 3.8 | 2.8 | 3.2 | 3.2 | 2.7 | 6.5 | 8 | ||||||
6a | 40.6 | 40.8 | 2.9 | 1 | |||||||||||||
6b | 44.8 | 44.8 | 4.0 | 1 | |||||||||||||
6c | 76.9 | 85.0 | 2.8 | 1 | |||||||||||||
6d | 85.3 | 85.3 | 3.0 | 1 | |||||||||||||
6e | 105.1 | 106.1 | 2.9 | 1 | |||||||||||||
7a | 14.9 | 22.2 | 3.7 | 1 | |||||||||||||
7b | 64.0 | 64.2 | 3.0 | 1 | |||||||||||||
10a | 9.8 | 11.0 | 2.9 | 1 | |||||||||||||
10b | 22.0 | 22.0 | 3.0 | 3.9 | 2 | ||||||||||||
10c | 86.1 | 89.9 | 3.1 | 1 | |||||||||||||
11a | 69.9 | 74.3 | 3.6 | 1 | |||||||||||||
11b | 95.1 | 107.3 | 5.5 | 5.2 | 2 | ||||||||||||
13 | 41.4 | 68.4 | 5.5 | 4.6 | 3.2 | 3 | |||||||||||
14a | 0.0 | 18.9 | 14.1 | 11.0 | 4.2 | 8.1 | 47.4 | 7.1 | 4.6 | 31.1 | 50.1 | 10.5 | 10 | ||||
14b | 44.2 | 50.9 | 3.6 | 1 | |||||||||||||
14c | 69.4 | 77.0 | 4.1 | 1 | |||||||||||||
15a | 20.9 | 20.9 | 3.6 | 1 | |||||||||||||
15b | 64.1 | 72.9 | 3.0 | 1 | |||||||||||||
16a | 2.1 | 3.7 | 2.2 | 1 | |||||||||||||
16b | 51.2 | 68.0 | 3.0 | 1 | |||||||||||||
17a | 15.0 | 23.9 | 3.3 | 3.9 | 3.7 | 3 | |||||||||||
17b | 24.7 | 24.7 | 3.0 | 1 | |||||||||||||
17c | 28.6 | 34.3 | 5.3 | 8.2 | 4.1 | 3 | |||||||||||
17d | 49.6 | 68.7 | 3.3 | 4.4 | 2 | ||||||||||||
17e | 74.0 | 74.0 | 2.2 | 1 | |||||||||||||
19a | 6.1 | 6.1 | 2.9 | 1 | |||||||||||||
19b | 37.3 | 62.3 | 6.0 | 5.7 | 6.3 | 12.3 | 4.3 | 5 | |||||||||
20 | 8.5 | 26.1 | 2.8 | 15.6 | 4.0 | 3 | |||||||||||
21 | 63.8 | 65.2 | 4.2 | 1 | |||||||||||||
22a | 11.8 | 11.8 | 2.9 | 1 | |||||||||||||
22b | 16.2 | 16.2 | 3.7 | 1 | |||||||||||||
23a | 15.5 | 23.8 | 2.7 | 1 | |||||||||||||
23b | 26.3 | 33.2 | 4.3 | 1 | |||||||||||||
23c | 42.7 | 48.5 | 4.1 | 1 | |||||||||||||
26 | 1.4 | 39.0 | 4.5 | 20.6 | 15.0 | 46.4 | 30.7 | 5 | |||||||||
27 | 42.7 | 47.6 | 2.6 | 1 | |||||||||||||
28 | 3.1 | 3.1 | 4.9 | 3.1 | 2 | ||||||||||||
29a | 32.7 | 32.7 | 2.6 | 1 | |||||||||||||
29b | 44.3 | 44.3 | 3.5 | 1 | |||||||||||||
X | 63.1 | 63.1 | 3.9 | 1 | |||||||||||||
Sum | 5.5 | 52.8 | 43.6 | 39.3 | 10.2 | 25.4 | 55.4 | 15.6 | 38.3 | 23.6 | 68.0 | 145.3 | 65.2 | 10.5 | |||
All SNPs in model2 | 5.5 | 28.4 | 35.6 | 29.3 | 6.5 | 21.4 | 51.2 | 15.6 | 37.1 | 22.0 | 61.8 | 92.5 | 63.6 | 10.5 | |||
# Regions/trait | 1 | 10 | 7 | 11 | 2 | 4 | 3 | 1 | 5 | 3 | 8 | 27 | 4 | 1 | 87 | ||