TY - STD TI - The US Department of Agriculture Foreign Agricultural Service. http://www.pecad.fas.usda.gov/highlights/2010/11/global%20durum/, UR - http://www.pecad.fas.usda.gov/highlights/2010/11/global%20durum/ ID - ref1 ER - TY - JOUR AU - Röder, M. S. AU - Korzun, V. AU - Wendehake, K. AU - Plaschke, J. AU - Tixier, M. H. AU - Leroy, P. AU - Ganal, M. W. PY - 2009 DA - 2009// TI - A microsatellite map of wheat JO - Genetics VL - 149 ID - Röder2009 ER - TY - JOUR AU - Akbari, M. AU - Wenzl, P. AU - Caig, V. AU - Carling, J. AU - Xia, L. AU - Yang, S. AU - Uszynski, G. AU - Mohler, V. AU - Lehmensiek, A. AU - Kuchel, H. AU - Hayden, M. J. AU - Howes, N. AU - Sharp, P. AU - Vaughan, P. AU - Rathmell, B. AU - Huttner, E. AU - Kilian, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Diversity arrays technology (DArT) for high-throughput profiling of the hexaploid wheat genome JO - Theor Appl Genet VL - 113 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-006-0365-4 DO - 10.1007/s00122-006-0365-4 ID - Akbari2006 ER - TY - JOUR AU - Huang, X. AU - Zeller, F. J. AU - Hsam, S. L. AU - Wenzel, G. AU - Mohler, V. PY - 2000 DA - 2000// TI - Chromosomal location of AFLP markers in common wheat utilizing nulli-tetrasomic stocks JO - Genome VL - 43 UR - https://doi.org/10.1139/g99-118 DO - 10.1139/g99-118 ID - Huang2000 ER - TY - JOUR AU - Brenchley, R. AU - Spannagl, M. AU - Pfeifer, M. AU - Barker, G. L. AU - D'Amore, R. AU - Allen, A. M. AU - McKenzie, N. AU - Kramer, M. AU - Kerhornou, A. AU - Bolser, D. AU - Kay, S. AU - Waite, D. AU - Trick, M. AU - Bancroft, I. AU - Gu, Y. AU - Huo, N. AU - Luo, M. C. AU - Sehgal, S. AU - Gill, B. AU - Kianian, S. AU - Anderson, O. AU - Kersey, P. AU - Dvorak, J. AU - McCombie, W. R. AU - Hall, A. AU - Mayer, K. F. AU - Edwards, K. J. AU - Bevan, M. W. AU - Hall, N. PY - 2012 DA - 2012// TI - Analysis of the bread wheat genome using whole-genome shotgun sequencing JO - Nature VL - 491 UR - https://doi.org/10.1038/nature11650 DO - 10.1038/nature11650 ID - Brenchley2012 ER - TY - JOUR AU - Cavanagh, C. R. AU - Chao, S. AU - Wang, S. AU - Huang, B. E. AU - Stephen, S. AU - Kiani, S. AU - Forrest, K. AU - Saintenac, C. AU - Brown-Guedira, G. L. AU - Akhunova, A. AU - See, D. AU - Bai, G. AU - Pumphrey, M. AU - Tomar, L. AU - Wong, D. AU - Kong, S. AU - Reynolds, M. AU - da Silva, M. L. AU - Bockelman, H. AU - Talbert, L. AU - Anderson, J. A. AU - Dreisigacker, S. AU - Baenziger, S. AU - Carter, A. AU - Korzun, V. AU - Morrell, P. L. AU - Dubcovsky, J. AU - Morell, M. K. AU - Sorrells, M. E. AU - Hayden, M. J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Genome-wide comparative diversity uncovers multiple targets of selection for improvement in hexaploid wheat landraces and cultivars JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 110 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1217133110 DO - 10.1073/pnas.1217133110 ID - Cavanagh2013 ER - TY - JOUR AU - Akhunov, E. D. AU - Nicolet, C. AU - Dvorak, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Single nucleotide polymorphism genotyping in polyploid wheat with IlluminaGoldenGate assay JO - Theor Appl Genet VL - 119 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-009-1059-5 DO - 10.1007/s00122-009-1059-5 ID - Akhunov2009 ER - TY - JOUR AU - Peng, J. H. AU - Sun, D. AU - Nevo, E. PY - 2011 DA - 2011// TI - Domestication evolution, genetics and genomics in wheat JO - Mol Breed VL - 28 UR - https://doi.org/10.1007/s11032-011-9608-4 DO - 10.1007/s11032-011-9608-4 ID - Peng2011 ER - TY - BOOK AU - Zohary, D. AU - Hopf, M. AU - Weiss, E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Domestication of Plants in the Old World PB - Oxford University Press CY - Oxford UR - https://doi.org/10.1093/acprof:osobl/9780199549061.001.0001 DO - 10.1093/acprof:osobl/9780199549061.001.0001 ID - Zohary2012 ER - TY - JOUR AU - Salamini, F. AU - Ozkan, H. AU - Brandolini, A. AU - Schäfer-Pregl, R. AU - Martin, W. PY - 2002 DA - 2002// TI - Genetics and geography of wild cereal domestication in the near east JO - Nat Rev Genet VL - 3 ID - Salamini2002 ER - TY - JOUR AU - Luo, M. C. AU - You, F. M. AU - Kawahara, T. AU - Waines, J. G. AU - Dvorak, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - The structure of wild and domesticated emmer wheat populations, gene flow between them, and the site of emmer domestication JO - Theor Appl Genet VL - 114 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-006-0474-0 DO - 10.1007/s00122-006-0474-0 ID - Luo2007 ER - TY - JOUR AU - Oliveira, H. R. AU - Campana, M. AU - Jones, H. AU - Hunt, H. AU - Leigh, F. AU - Lister, D. L. AU - Jones, M. K. PY - 2012 DA - 2012// TI - Tetraploid wheat landraces in the Mediterranean basin: taxonomy, evolution and genetic diversity JO - PLoS ONE VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0037063 DO - 10.1371/journal.pone.0037063 ID - Oliveira2012 ER - TY - JOUR AU - Dvorak, J. AU - Deal, K. R. AU - Luo, M. C. AU - You, F. M. AU - von Borstel, K. AU - Dehghani, H. PY - 2012 DA - 2012// TI - The origin of spelt and free-threshing hexaploid wheat JO - J Hered VL - 103 UR - https://doi.org/10.1093/jhered/esr152 DO - 10.1093/jhered/esr152 ID - Dvorak2012 ER - TY - JOUR AU - Haudry, A. AU - Cenci, A. AU - Ravel, C. AU - Bataillon, T. AU - Brunel, D. AU - Poncet, C. AU - Hochu, I. AU - Poirier, S. AU - Santoni, S. AU - Glémin, S. AU - David, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Grinding up wheat: a massive loss of nucleotide diversity since domestication JO - Mol Biol Evol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msm077 DO - 10.1093/molbev/msm077 ID - Haudry2007 ER - TY - JOUR AU - Korzun, V. AU - Röder, M. S. AU - Wendehake, K. AU - Pasqualone, A. AU - Lotti, C. AU - Ganal, M. W. AU - Blanco, A. PY - 1999 DA - 1999// TI - Integration of dinucleotide microsatellites from hexaploid bread wheat into a genetic linkage map of durum wheat JO - Theor Appl Genet VL - 98 UR - https://doi.org/10.1007/s001220051185 DO - 10.1007/s001220051185 ID - Korzun1999 ER - TY - JOUR AU - Trebbi, D. AU - Maccaferri, M. AU - de Heer, P. AU - Sørensen, A. AU - Giuliani, S. AU - Salvi, S. AU - Sanguineti, M. C. AU - Massi, A. AU - van der Vossen, E. A. AU - Tuberosa, R. PY - 2011 DA - 2011// TI - High-throughput SNP discovery and genotyping in durum wheat (Triticum durum Desf.) JO - Theor Appl Genet VL - 123 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1607-7 DO - 10.1007/s00122-011-1607-7 ID - Trebbi2011 ER - TY - CHAP AU - Jauhar, P. P. AU - Damania, A. B. ED - Damania, A. B. PY - 1993 DA - 1993// TI - Alien gene transfer and genetic enrichment of bread wheat BT - Biodiversity and wheat improvement PB - Sons CY - New York ID - Jauhar1993 ER - TY - JOUR AU - Moragues, M. AU - Moralejo, M. AU - Sorrels, M. AU - Royo, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Dispersal of durum wheat [Triticum turgidum L. ssp. turgidum convar. durum (Desf.) MacKey] landraces across the Mediterranean basin assessed by AFLPs and microsatellites JO - Genet Resour Crop Evol VL - 54 UR - https://doi.org/10.1007/s10722-006-9005-8 DO - 10.1007/s10722-006-9005-8 ID - Moragues2007 ER - TY - JOUR AU - Isaac, A. D. AU - Muldoon, M. AU - Brown, K. A. AU - Brown, T. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genetic analysis of wheat landraces enables the location of the first agricultural sites in Italy to be identified JO - JArch Sci VL - 37 ID - Isaac2010 ER - TY - JOUR AU - Nordborg, M. AU - Hu, T. T. AU - Ishino, Y. AU - Jhaveri, J. AU - Toomajian, C. AU - Zheng, H. AU - Bakker, E. AU - Calabrese, P. AU - Gladstone, J. AU - Goyal, R. AU - Jakobsson, M. AU - Kim, S. AU - Morozov, Y. AU - Padhukasahasram, B. AU - Plagnol, V. AU - Rosenberg, N. A. AU - Shah, C. AU - Wall, J. D. AU - Wang, J. AU - Zhao, K. AU - Kalbfleisch, T. AU - Schulz, V. AU - Kreitman, M. AU - Bergelson, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - The pattern of polymorphism in Arabidopsis thaliana JO - PLoS Biol VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0030196 DO - 10.1371/journal.pbio.0030196 ID - Nordborg2005 ER - TY - JOUR AU - Russell, J. AU - Dawson, I. K. AU - Flavell, A. J. AU - Steffenson, B. AU - Weltzien, E. AU - Booth, A. AU - Ceccarelli, S. AU - Grando, S. AU - Waugh, R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Analysis of >1000 single nucleotide polymorphisms in geographically matched samples of landrace and wild barley indicates secondary contact and chromosome-level differences in diversity around domestication genes JO - New Phytol VL - 191 UR - https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2011.03704.x DO - 10.1111/j.1469-8137.2011.03704.x ID - Russell2011 ER - TY - JOUR AU - Albrechtsen, A. AU - Nielsen, F. C. AU - Nielsen, R. PY - 2010 DA - 2010// TI - Ascertainment biases in SNP chips affect measures of population divergence JO - Mol Biol Evol VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msq148 DO - 10.1093/molbev/msq148 ID - Albrechtsen2010 ER - TY - JOUR AU - Hübner, S. AU - Günther, T. AU - Flavell, A. AU - Fridman, E. AU - Graner, A. AU - Korol, A. AU - Schmid, K. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Islands and streams: clusters and gene flow in wild barley populations from the Levant JO - Mol Ecol VL - 21 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2011.05434.x DO - 10.1111/j.1365-294X.2011.05434.x ID - Hübner2012 ER - TY - JOUR AU - Allen, A. M. AU - Barker, G. L. AU - Berry, S. T. AU - Coghill, J. A. AU - Gwilliam, R. AU - Kirby, S. AU - Robinson, P. AU - Brenchley, R. C. AU - D'Amore, R. AU - McKenzie, N. AU - Waite, D. AU - Hall, A. AU - Bevan, M. AU - Hall, N. AU - Edwards, K. J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Transcript-specific, single-nucleotide polymorphism discovery and linkage analysis in hexaploid bread wheat (Triticum aestivum L.) JO - Plant Biotechnol J VL - 9 UR - https://doi.org/10.1111/j.1467-7652.2011.00628.x DO - 10.1111/j.1467-7652.2011.00628.x ID - Allen2011 ER - TY - JOUR AU - Nei, M. PY - 1973 DA - 1973// TI - Analysis of gene diversity in subdivided populations JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 70 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.70.12.3321 DO - 10.1073/pnas.70.12.3321 ID - Nei1973 ER - TY - JOUR AU - Tajima, F. PY - 1989 DA - 1989// TI - Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis by DNA polymorphism JO - Genetics VL - 123 ID - Tajima1989 ER - TY - STD TI - Cereals Database UK. http://www.cerealsdb.uk.net/cerealgenomics/CerealsDB/indexNEW.php, UR - http://www.cerealsdb.uk.net/cerealgenomics/CerealsDB/indexNEW.php ID - ref27 ER - TY - JOUR AU - Pritchard, J. K. AU - Stephens, M. AU - Donnelly, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Inference of population structure using multilocus genotype data JO - Genetics VL - 155 ID - Pritchard2000 ER - TY - JOUR AU - Evanno, G. AU - Regnaut, S. AU - Goudet, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study JO - Mol Ecol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x DO - 10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x ID - Evanno2005 ER - TY - JOUR AU - Jakobsson, M. AU - Rosenberg, N. A. PY - 2007 DA - 2007// TI - CLUMPP: a cluster matching and permutation program for dealing with label switching and multimodality in analysis of population structure JO - Bioinformatics VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm233 DO - 10.1093/bioinformatics/btm233 ID - Jakobsson2007 ER - TY - JOUR AU - Rosenberg, N. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Distruct: a program for the graphical display of population structure JO - Mol Ecol Notes VL - 4 UR - https://doi.org/10.1046/j.1471-8286.2003.00566.x DO - 10.1046/j.1471-8286.2003.00566.x ID - Rosenberg2004 ER - TY - JOUR AU - Conrad, D. F. AU - Jakobsson, M. AU - Coop, G. AU - Wen, X. AU - Wall, J. D. AU - Rosenberg, N. A. AU - Pritchard, J. K. PY - 2006 DA - 2006// TI - A worldwide survey of haplotype variation and linkage disequilibrium in the human genome JO - Nat Genet VL - 38 UR - https://doi.org/10.1038/ng1911 DO - 10.1038/ng1911 ID - Conrad2006 ER - TY - JOUR AU - Nielsen, R. PY - 2000 DA - 2000// TI - Estimation of population parameters and recombination rates from single nucleotide polymorphisms JO - Genetics VL - 154 ID - Nielsen2000 ER - TY - JOUR AU - Peleg, Z. AU - Saranga, Y. AU - Suprunova, T. AU - Ronin, Y. AU - Röder, M. S. AU - Kilian, A. AU - Korol, A. B. AU - Fahima, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - High-density genetic map of durum wheat x wild emmer wheat based on SSR and DArT markers JO - Theor Appl Genet VL - 117 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-008-0756-9 DO - 10.1007/s00122-008-0756-9 ID - Peleg2008 ER - TY - JOUR AU - Würschum, T. AU - Langer, S. M. AU - Longin, C. F. AU - Korzun, V. AU - Akhunov, E. AU - Ebmeyer, E. AU - Schachschneider, R. AU - Schacht, J. AU - Kazman, E. AU - Reif, J. C. PY - 2013 DA - 2013// TI - Population structure, genetic diversity and linkage disequilibrium in elite winter wheat assessed with SNP and SSR markers JO - Theor Appl Genet VL - 126 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-013-2065-1 DO - 10.1007/s00122-013-2065-1 ID - Würschum2013 ER - TY - JOUR AU - Zhang, D. AU - Bai, G. AU - Zhu, C. AU - Yu, J. AU - Carver, B. F. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genetic diversity, population structure, and linkage disequilibrium in U.S. elite winter wheat JO - Plant Genome VL - 3 UR - https://doi.org/10.3835/plantgenome2010.03.0004 DO - 10.3835/plantgenome2010.03.0004 ID - Zhang2010 ER - TY - JOUR AU - Chao, S. AU - Dubcovsky, J. AU - Dvorak, J. AU - Luo, M. C. AU - Baenziger, S. P. AU - Matnyazov, R. AU - Clark, D. R. AU - Talbert, L. E. AU - Anderson, J. A. AU - Dreisigacker, S. AU - Glover, K. AU - Chen, J. AU - Campbell, K. AU - Bruckner, P. L. AU - Rudd, J. C. AU - Haley, S. AU - Carver, B. F. AU - Perry, S. AU - Sorrells, M. E. AU - Akhunov, E. D. PY - 2010 DA - 2010// TI - Population- and genome-specific patterns of linkage disequilibrium and SNP variation in spring and winter wheat (Triticum aestivum L.) JO - BMC Genomics VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-11-727 DO - 10.1186/1471-2164-11-727 ID - Chao2010 ER - TY - JOUR AU - Chen, X. AU - Min, D. AU - Yasir, T. A. AU - Hu, Y. G. PY - 2012 DA - 2012// TI - Genetic diversity, population structure and linkage disequilibrium in elite Chinese winter wheat investigated with SSR markers JO - PLoS ONE VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0044510 DO - 10.1371/journal.pone.0044510 ID - Chen2012 ER - TY - JOUR AU - Maccaferri, M. AU - Sanguineti, M. C. AU - Demontis, A. AU - El-Ahmed, A. AU - Garcia del Moral, L. AU - Maalouf, F. AU - Nachit, M. AU - Nserallah, N. AU - Ouabbou, H. AU - Rhouma, S. AU - Royo, C. AU - Villegas, D. AU - Tuberosa, R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Association mapping in durum wheat grown across a broad range of water regimes JO - J Exp Bot VL - 62 UR - https://doi.org/10.1093/jxb/erq287 DO - 10.1093/jxb/erq287 ID - Maccaferri2011 ER - TY - JOUR AU - Maccaferri, M. AU - Sanguineti, M. C. AU - Noli, E. AU - Tuberosa, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Population structure and long-range linkage disequilibrium in a durum wheat elite collection JO - Mol Breed VL - 15 UR - https://doi.org/10.1007/s11032-004-7012-z DO - 10.1007/s11032-004-7012-z ID - Maccaferri2005 ER - TY - JOUR AU - Somers, D. J. AU - Banks, T. AU - Depauw, R. AU - Fox, S. AU - Clarke, J. AU - Pozniak, C. AU - McCartney, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Genome-wide linkage disequilibrium analysis in bread wheat and durum wheat JO - Genome VL - 50 UR - https://doi.org/10.1139/G07-031 DO - 10.1139/G07-031 ID - Somers2007 ER - TY - JOUR AU - Van Inghelandt, D. AU - Melchinger, A. E. AU - Lebreton, C. AU - Stich, B. PY - 2010 DA - 2010// TI - Population structure and genetic diversity in a commercial maize breeding program assessed with SSR and SNP markers JO - Theor Appl Genet VL - 120 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-009-1256-2 DO - 10.1007/s00122-009-1256-2 ID - Van Inghelandt2010 ER - TY - JOUR AU - Haasl, R. J. AU - Payseur, B. A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Multi-locus inference of population structure: a comparison between single nucleotide polymorphisms and microsatellites JO - Heredity VL - 106 UR - https://doi.org/10.1038/hdy.2010.21 DO - 10.1038/hdy.2010.21 ID - Haasl2011 ER -