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Table 2 Allele and genotype frequencies

From: Complex genetic predisposition in adult and juvenile rheumatoid arthritis

  allele 01 (%) allele 02 (%) pc
TNFA -238a/g    
CON (n = 375) 726 (96.8) 24 (3.2)  
RA (n = 170) 323 (95.0) 17 (5.0) n.s.
JRA (n = 130) 254 (97.7) 6 (2.3) n.s.
TNFA -308a/g    
CON (n = 312) 527 (84.5) 97 (15.5)  
RA (n = 151) 257 (85.1) 45 (14.9) n.s.
JRA (n = 122) 202 (82.8) 42 (17.2) n.s.
TNFA -857c/t    
CON (n = 415) 738 (88.9) 92 (11.1)  
RA (n = 191) 343 (89.8) 39 (10.2) n.s.
JRA (n = 170) 299 (87.9) 41 (12.1) n.s.
TNFR1 -609g/t    
CON (n = 324) 384 (59.3) 264 (40.7)  
RA (n = 173) 221 (63.9) 125 (36.1) n.s.
JRA (n = 136) 166 (61.0) 106 (39.0) n.s.
TNFR1 P12P    
CON (n = 334) 361 (54.0) 307 (46.0)  
RA (n = 166) 167 (50.3) 165 (49.7) n.s.
JRA (n = 132) 154 (58.3) 110 (41.7) n.s.
TNFR2 del15    
CON (n = 428) 621 (72.5) 235 (27.5)  
RA (n = 190) 255 (67.1) 125 (32.9) 0.1
JRA (n = 146) 195 (66.7) 97 (33.3) 0.1
IKBL -332a/g    
CON (n = 389) 711 (91.4) 67 (8.6)  
RA (n = 184) 333 (90.5) 35 (9.5) n.s.
JRA (n = 170) 316 (92.9) 24 (7.1) n.s.
IKBL -132t/a    
CON (n = 389) 555 (71.3) 223 (28.7)  
RA (n = 177) 263 (74.3) 91 (25.7) n.s.
JRA (n = 170) 232 (68.2) 108 (31.8) n.s.
IKBL C224R    
CON (n = 379) 701 (92.5) 57 (7.5)  
RA (n = 189) 359 (95.0) 19 (5.0) n.s.
JRA (n = 169) 320 (94.7) 18 (5.3) n.s.
CTLA4 -318c/t    
CON (n = 362) 674 (93.1) 50 (6.9)  
RA (n = 284) 504 (88.7) 64 (11.3) 0.01
JRA (n = 197) 342 (86.8) 52 (13.2) 0.001
CTLA4 T17A    
CON (n = 362) 455 (62.8) 269 (37.2)  
RA (n = 284) 346 (60.9) 222 (39.1) n.s.
JRA (n = 197) 255 (64.7) 139 (35.3) n.s.
PTPRC P57P    
CON (n = 347) 684 (98.6) 10 (1.4)  
RA (n = 195) 382 (97.9) 8 (2.1) n.s.
JRA (n = 161) 316 (98.1) 6 (1.9) n.s.
MIF -173g/c    
CON (n = 390) 616 (79.0) 164 (21.0)  
RA (n = 168) 285 (84.8) 51 (15.2) 0.05
JRA (n = 150) 227 (75.7) 73 (24.39) n.s.
  1. CON: healthy controls, RA: adult RA patients, JRA juvenile RA patients