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Table 2 Allele and genotype frequencies

From: Complex genetic predisposition in adult and juvenile rheumatoid arthritis

 

allele 01 (%)

allele 02 (%)

pc

TNFA -238a/g

   

CON (n = 375)

726 (96.8)

24 (3.2)

 

RA (n = 170)

323 (95.0)

17 (5.0)

n.s.

JRA (n = 130)

254 (97.7)

6 (2.3)

n.s.

TNFA -308a/g

   

CON (n = 312)

527 (84.5)

97 (15.5)

 

RA (n = 151)

257 (85.1)

45 (14.9)

n.s.

JRA (n = 122)

202 (82.8)

42 (17.2)

n.s.

TNFA -857c/t

   

CON (n = 415)

738 (88.9)

92 (11.1)

 

RA (n = 191)

343 (89.8)

39 (10.2)

n.s.

JRA (n = 170)

299 (87.9)

41 (12.1)

n.s.

TNFR1 -609g/t

   

CON (n = 324)

384 (59.3)

264 (40.7)

 

RA (n = 173)

221 (63.9)

125 (36.1)

n.s.

JRA (n = 136)

166 (61.0)

106 (39.0)

n.s.

TNFR1 P12P

   

CON (n = 334)

361 (54.0)

307 (46.0)

 

RA (n = 166)

167 (50.3)

165 (49.7)

n.s.

JRA (n = 132)

154 (58.3)

110 (41.7)

n.s.

TNFR2 del15

   

CON (n = 428)

621 (72.5)

235 (27.5)

 

RA (n = 190)

255 (67.1)

125 (32.9)

0.1

JRA (n = 146)

195 (66.7)

97 (33.3)

0.1

IKBL -332a/g

   

CON (n = 389)

711 (91.4)

67 (8.6)

 

RA (n = 184)

333 (90.5)

35 (9.5)

n.s.

JRA (n = 170)

316 (92.9)

24 (7.1)

n.s.

IKBL -132t/a

   

CON (n = 389)

555 (71.3)

223 (28.7)

 

RA (n = 177)

263 (74.3)

91 (25.7)

n.s.

JRA (n = 170)

232 (68.2)

108 (31.8)

n.s.

IKBL C224R

   

CON (n = 379)

701 (92.5)

57 (7.5)

 

RA (n = 189)

359 (95.0)

19 (5.0)

n.s.

JRA (n = 169)

320 (94.7)

18 (5.3)

n.s.

CTLA4 -318c/t

   

CON (n = 362)

674 (93.1)

50 (6.9)

 

RA (n = 284)

504 (88.7)

64 (11.3)

0.01

JRA (n = 197)

342 (86.8)

52 (13.2)

0.001

CTLA4 T17A

   

CON (n = 362)

455 (62.8)

269 (37.2)

 

RA (n = 284)

346 (60.9)

222 (39.1)

n.s.

JRA (n = 197)

255 (64.7)

139 (35.3)

n.s.

PTPRC P57P

   

CON (n = 347)

684 (98.6)

10 (1.4)

 

RA (n = 195)

382 (97.9)

8 (2.1)

n.s.

JRA (n = 161)

316 (98.1)

6 (1.9)

n.s.

MIF -173g/c

   

CON (n = 390)

616 (79.0)

164 (21.0)

 

RA (n = 168)

285 (84.8)

51 (15.2)

0.05

JRA (n = 150)

227 (75.7)

73 (24.39)

n.s.

  1. CON: healthy controls, RA: adult RA patients, JRA juvenile RA patients