Table 3 Power for detecting interactions between loci using LODPAL (NY population)
From: Methods for detecting gene × gene interaction in multiplex extended pedigrees
Phenotype | SNP covariate | Model | Marker-region | Power (single point) | Power (multipoint) |
|---|---|---|---|---|---|
KPD | D1 | dom | D2 | 0.23 | 0.20 |
rec | D2 | 0.18 | 0.22 | ||
dom | D4 | 0.19 | 0.17 | ||
rec | D4 | 0.14 | 0.11 | ||
D2 | dom | D1 | 0.29 | 0.22 | |
rec | D1 | 0.25 | 0.21 | ||
dom | D3 | 0.22 | 0.19 | ||
rec | D3 | 0.15 | 0.10 | ||
D3 | dom | D2 | 0.26 | 0.23 | |
rec | D2 | 0.17 | 0.15 | ||
dom | D4 | 0.20 | 0.20 | ||
rec | D4 | 0.12 | 0.14 | ||
D4 | dom | D1 | 0.32 | 0.26 | |
rec | D1 | 0.25 | 0.20 | ||
dom | D3 | 0.23 | 0.23 | ||
rec | D3 | 0.15 | 0.13 | ||
P1 | D1 | dom | D2 | 0.14 | 0.10 |
rec | D2 | 0.18 | 0.14 | ||
D2 | dom | D1 | 0.42 | 0.29 | |
rec | D1 | 0.32 | 0.34 | ||
P2 | D2 | dom | D3 | 0.21 | 0.18 |
rec | D3 | 0.13 | 0.09 | ||
D3 | dom | D2 | 0.22 | 0.14 | |
rec | D2 | 0.11 | 0.10 | ||
dom | D4 | 0.16 | 0.17 | ||
rec | D4 | 0.18 | 0.13 | ||
D4 | dom | D3 | 0.18 | 0.21 | |
rec | D3 | 0.16 | 0.12 | ||
P3 | D1 | dom | D4 | 0.14 | 0.09 |
rec | D4 | 0.08 | 0.07 | ||
D2 | dom | D3 | 0.14 | 0.08 | |
rec | D3 | 0.11 | 0.08 | ||
D3 | dom | D2 | 0.09 | 0.13 | |
rec | D2 | 0.12 | 0.09 | ||
D4 | dom | D1 | 0.25 | 0.19 | |
rec | D1 | 0.17 | 0.18 |