TY - JOUR AU - Nagel, R. L. AU - Fabry, M. E. AU - Pagnier, J. AU - Zohoun, I. AU - Wajcman, H. AU - Baudin, V. AU - Labie, D. PY - 1985 DA - 1985// TI - Hematologically and genetically distinct forms of sickle cell anemia in Africa. The Senegal type and the Benin type JO - N Engl J Med VL - 312 UR - https://doi.org/10.1056/NEJM198504043121403 DO - 10.1056/NEJM198504043121403 ID - Nagel1985 ER - TY - JOUR AU - Pagnier, J. AU - Mears, J. G. AU - Dunda-Belkhodja, O. AU - Schaefer-Rego, K. E. AU - Beldjord, C. AU - Nagel, R. L. AU - Labie, D. PY - 1984 DA - 1984// TI - Evidence for the multicentric origin of the sickle cell hemoglobin gene in Africa JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 81 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.81.6.1771 DO - 10.1073/pnas.81.6.1771 ID - Pagnier1984 ER - TY - JOUR AU - Orkin, S. H. AU - Kazazian, H. H. AU - Antonarakis, S. E. AU - Goff, S. C. AU - Boehm, C. D. AU - Sexton, J. P. AU - Waber, P. G. AU - Giardina, P. J. PY - 1982 DA - 1982// TI - Linkage of beta-thalassaemia mutations and beta-globin gene polymorphisms with DNA polymorphisms in human beta-globin gene cluster JO - Nature VL - 296 UR - https://doi.org/10.1038/296627a0 DO - 10.1038/296627a0 ID - Orkin1982 ER - TY - JOUR AU - Webster, M. T. AU - Clegg, J. B. AU - Harding, R. M. PY - 2003 DA - 2003// TI - Common 5' beta-globin RFLP haplotypes harbour a surprising level of ancestral sequence mosaicism JO - Hum Genet VL - 113 ID - Webster2003 ER - TY - JOUR AU - Fullerton, S. M. AU - Harding, R. M. AU - Boyce, A. J. AU - Clegg, J. B. PY - 1994 DA - 1994// TI - Molecular and population genetic analysis of allelic sequence diversity at the human beta-globin locus JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 91 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.91.5.1805 DO - 10.1073/pnas.91.5.1805 ID - Fullerton1994 ER - TY - JOUR AU - Rich, S. M. AU - Licht, M. C. AU - Hudson, R. R. AU - Ayala, F. J. PY - 1998 DA - 1998// TI - Malaria's Eve: evidence of a recent population bottleneck throughout the world populations of Plasmodium falciparum JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 95 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.95.8.4425 DO - 10.1073/pnas.95.8.4425 ID - Rich1998 ER - TY - JOUR AU - Flint, J. AU - Harding, R. M. AU - Boyce, A. J. AU - Clegg, J. B. PY - 1998 DA - 1998// TI - The population genetics of the haemoglobinopathies JO - Baillieres Clin Haematol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/S0950-3536(98)80069-3 DO - 10.1016/S0950-3536(98)80069-3 ID - Flint1998 ER - TY - JOUR AU - Wainscoat, J. S. AU - Bell, J. I. AU - Thein, S. L. AU - Higgs, D. R. AU - Sarjeant, G. R. AU - Peto, T. E. AU - Weatherall, D. J. PY - 1983 DA - 1983// TI - Multiple origins of the sickle mutation: evidence from beta S globin gene cluster polymorphisms JO - Mol Biol Med VL - 1 ID - Wainscoat1983 ER - TY - JOUR AU - Antonarakis, S. E. AU - Boehm, C. D. AU - Serjeant, G. R. AU - Theisen, C. E. AU - Dover, G. J. AU - Kazazian, H. H. PY - 1984 DA - 1984// TI - Origin of the beta S-globin gene in blacks: the contribution of recurrent mutation or gene conversion or both JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 81 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.81.3.853 DO - 10.1073/pnas.81.3.853 ID - Antonarakis1984 ER - TY - JOUR AU - Hill, A. V. AU - Allsopp, C. E. AU - Kwiatkowski, D. AU - Anstey, N. M. AU - Twumasi, P. AU - Rowe, P. A. AU - Bennett, S. AU - Brewster, D. AU - McMichael, A. J. AU - Greenwood, B. M. PY - 1991 DA - 1991// TI - Common west African HLA antigens are associated with protection from severe malaria JO - Nature VL - 352 UR - https://doi.org/10.1038/352595a0 DO - 10.1038/352595a0 ID - Hill1991 ER - TY - JOUR AU - Aidoo, M. AU - Terlouw, D. J. AU - Kolczak, M. S. AU - McElroy, P. D. AU - ter Kuile, F. O. AU - Kariuki, S. AU - Nahlen, B. L. AU - Lal, A. A. AU - Udhayakumar, V. PY - 2002 DA - 2002// TI - Protective effects of the sickle cell gene against malaria morbidity and mortality JO - Lancet VL - 359 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(02)08273-9 DO - 10.1016/S0140-6736(02)08273-9 ID - Aidoo2002 ER - TY - JOUR AU - Jelliffe, D. B. AU - Humphreys, J. PY - 1952 DA - 1952// TI - The sickle-cell trait in western Nigeria; a survey of 1,881 cases in the Yoruba JO - Br Med J VL - 1 UR - https://doi.org/10.1136/bmj.1.4755.405 DO - 10.1136/bmj.1.4755.405 ID - Jelliffe1952 ER - TY - JOUR AU - Allison, A. C. PY - 1954 DA - 1954// TI - The distribution of the sickle-cell trait in East Africa and elsewhere, and its apparent relationship to the incidence of subtertian malaria JO - Trans R Soc Trop Med Hyg VL - 48 UR - https://doi.org/10.1016/0035-9203(54)90101-7 DO - 10.1016/0035-9203(54)90101-7 ID - Allison1954 ER - TY - CHAP AU - Bersaglieri, T. AU - Sabeti, P. C. AU - Patterson, N. AU - Vanderploeg, T. AU - Schaffner, S. F. AU - Drake, J. A. AU - Rhodes, M. AU - Reich, D. E. AU - Hirschhorn, J. N. PY - 2004 DA - 2004// TI - Genetic Signatures of Strong Recent Positive Selection at the Lactase Gene BT - Am J Hum Genet ID - Bersaglieri2004 ER - TY - CHAP AU - Ohashi, J. AU - Naka, I. AU - Patarapotikul, J. AU - Hananantachai, H. AU - Brittenham, G. AU - Looareesuwan, S. AU - Clark, A. G. AU - Tokunaga, K. PY - 2004 DA - 2004// TI - Extended Linkage Disequilibrium Surrounding the Hemoglobin E Variant Due to Malarial Selection BT - Am J Hum Genet ID - Ohashi2004 ER - TY - JOUR AU - Hanchard, N. A. AU - Rockett, K. A. AU - Spencer, C. AU - Coop, G. AU - Pinder, M. AU - Jallow, M. AU - Kimber, M. AU - McVean, G. AU - Mott, R. AU - Kwiatkowski, D. P. PY - 2006 DA - 2006// TI - Screening for recently selected alleles by analysis of human haplotype similarity JO - Am J Hum Genet VL - 78 UR - https://doi.org/10.1086/499252 DO - 10.1086/499252 ID - Hanchard2006 ER - TY - JOUR AU - Harding, R. M. AU - Fullerton, S. M. AU - Griffiths, R. C. AU - Bond, J. AU - Cox, M. J. AU - Schneider, J. A. AU - Moulin, D. S. AU - Clegg, J. B. PY - 1997 DA - 1997// TI - Archaic African and Asian lineages in the genetic ancestry of modern humans JO - Am J Hum Genet VL - 60 ID - Harding1997 ER - TY - JOUR AU - Powars, D. AU - Hiti, A. PY - 1993 DA - 1993// TI - Sickle cell anemia. Beta s gene cluster haplotypes as genetic markers for severe disease expression JO - Am J Dis Child VL - 147 UR - https://doi.org/10.1001/archpedi.1993.02160350071011 DO - 10.1001/archpedi.1993.02160350071011 ID - Powars1993 ER - TY - JOUR AU - Powars, D. R. AU - Chan, L. AU - Schroeder, W. A. PY - 1990 DA - 1990// TI - Beta S-gene-cluster haplotypes in sickle cell anemia: clinical implications JO - Am J Pediatr Hematol Oncol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1097/00043426-199023000-00022 DO - 10.1097/00043426-199023000-00022 ID - Powars1990 ER - TY - JOUR AU - Altshuler, D. AU - Brooks, L. D. AU - Chakravarti, A. AU - Collins, F. S. AU - Daly, M. J. AU - Donnelly, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - A haplotype map of the human genome JO - Nature VL - 437 UR - https://doi.org/10.1038/nature04226 DO - 10.1038/nature04226 ID - Altshuler2005 ER - TY - JOUR AU - Currat, M. AU - Trabuchet, G. AU - Rees, D. AU - Perrin, P. AU - Harding, R. M. AU - Clegg, J. B. AU - Langaney, A. AU - Excoffier, L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Molecular analysis of the beta-globin gene cluster in the Niokholo Mandenka population reveals a recent origin of the beta(S) Senegal mutation JO - Am J Hum Genet VL - 70 UR - https://doi.org/10.1086/338304 DO - 10.1086/338304 ID - Currat2002 ER - TY - STD TI - WHO: Africa Malaria Report. [http://www.rbm.who.int/amd2003/amr2003/amr_toc.htm] UR - http://www.rbm.who.int/amd2003/amr2003/amr_toc.htm ID - ref22 ER - TY - CHAP AU - Chandler, D. PY - 1972 DA - 1972// TI - Health and slavery: a study of health conditions among Negro slaves in the Viceroyalty of New Granada and its associated slave trade, 1600-1810. BT - Doctoral Dissertation, History section, Latin American Library ID - Chandler1972 ER - TY - JOUR AU - Boyd, M. F. AU - Aris, F. W. PY - 1929 DA - 1929// TI - A malaria survey of the island of Jamaica, BWI JO - American Journal of Tropical Medicine and Hygiene VL - 9 ID - Boyd1929 ER - TY - JOUR AU - Voight, B. F. AU - Kudaravalli, S. AU - Wen, X. AU - Pritchard, J. K. PY - 2006 DA - 2006// TI - A map of recent positive selection in the human genome JO - PLoS Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0040072 DO - 10.1371/journal.pbio.0040072 ID - Voight2006 ER - TY - JOUR AU - Wood, E. T. AU - Stover, D. A. AU - Slatkin, M. AU - Nachman, M. W. AU - Hammer, M. F. PY - 2005 DA - 2005// TI - The beta -globin recombinational hotspot reduces the effects of strong selection around HbC, a recently arisen mutation providing resistance to malaria JO - Am J Hum Genet VL - 77 UR - https://doi.org/10.1086/491748 DO - 10.1086/491748 ID - Wood2005 ER - TY - JOUR AU - Sabeti, P. C. AU - Reich, D. E. AU - Higgins, J. M. AU - Levine, H. Z. AU - Richter, D. J. AU - Schaffner, S. F. AU - Gabriel, S. B. AU - Platko, J. V. AU - Patterson, N. J. AU - McDonald, G. J. AU - Ackerman, H. C. AU - Campbell, S. J. AU - Altshuler, D. AU - Cooper, R. AU - Kwiatkowski, D. AU - Ward, R. AU - Lander, E. S. PY - 2002 DA - 2002// TI - Detecting recent positive selection in the human genome from haplotype structure JO - Nature VL - 419 UR - https://doi.org/10.1038/nature01140 DO - 10.1038/nature01140 ID - Sabeti2002 ER - TY - JOUR AU - Powars, D. R. AU - Chan, L. AU - Schroeder, W. A. PY - 1989 DA - 1989// TI - The influence of fetal hemoglobin on the clinical expression of sickle cell anemia JO - Ann N Y Acad Sci VL - 565 UR - https://doi.org/10.1111/j.1749-6632.1989.tb24174.x DO - 10.1111/j.1749-6632.1989.tb24174.x ID - Powars1989 ER - TY - JOUR AU - Cooper, R. AU - Rotimi, C. AU - Ataman, S. AU - McGee, D. AU - Osotimehin, B. AU - Kadiri, S. AU - Muna, W. AU - Kingue, S. AU - Fraser, H. AU - Forrester, T. AU - Bennett, F. AU - Wilks, R. PY - 1997 DA - 1997// TI - The prevalence of hypertension in seven populations of west African origin JO - Am J Public Health VL - 87 UR - https://doi.org/10.2105/AJPH.87.2.160 DO - 10.2105/AJPH.87.2.160 ID - Cooper1997 ER - TY - JOUR AU - Haverfield, E. V. AU - McKenzie, C. A. AU - Forrester, T. AU - Bouzekri, N. AU - Harding, R. AU - Serjeant, G. AU - Walker, T. AU - Peto, T. E. AU - Ward, R. AU - Weatherall, D. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - UGT1A1 variation and gallstone formation in sickle cell disease JO - Blood VL - 105 UR - https://doi.org/10.1182/blood-2004-02-0521 DO - 10.1182/blood-2004-02-0521 ID - Haverfield2005 ER - TY - STD TI - Coriell Institute for Medical Research. [http://locus.umdnj.edu/nigms/] UR - http://locus.umdnj.edu/nigms/ ID - ref31 ER - TY - STD TI - CST Genomic DNA Purification. [http://www.invitrogen.com] UR - http://www.invitrogen.com ID - ref32 ER - TY - STD TI - Nanodrop. [http://www.nanodrop.com] UR - http://www.nanodrop.com ID - ref33 ER - TY - STD TI - Ensembl database. [http://www.ensembl.org/] UR - http://www.ensembl.org/ ID - ref34 ER - TY - JOUR AU - Griffin, T. J. AU - Smith, L. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Single-nucleotide polymorphism analysis by MALDI-TOF mass spectrometry JO - Trends Biotechnol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1016/S0167-7799(99)01401-8 DO - 10.1016/S0167-7799(99)01401-8 ID - Griffin2000 ER - TY - JOUR AU - Hanchard, N. A. AU - Hambleton, I. AU - Harding, R. M. AU - McKenzie, C. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - The frequency of the sickle allele in Jamaica has not declined over the last 22 years JO - British Journal of Haematology VL - 130 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2141.2005.05704.x DO - 10.1111/j.1365-2141.2005.05704.x ID - Hanchard2005 ER - TY - STD TI - HapMap project. [http://www.hapmap.org/] UR - http://www.hapmap.org/ ID - ref37 ER - TY - JOUR AU - Stephens, M. AU - Smith, N. J. AU - Donnelly, P. PY - 2001 DA - 2001// TI - A new statistical method for haplotype reconstruction from population data JO - Am J Hum Genet VL - 68 UR - https://doi.org/10.1086/319501 DO - 10.1086/319501 ID - Stephens2001 ER - TY - JOUR AU - Stephens, M. AU - Donnelly, P. PY - 2003 DA - 2003// TI - A comparison of bayesian methods for haplotype reconstruction from population genotype data JO - Am J Hum Genet VL - 73 UR - https://doi.org/10.1086/379378 DO - 10.1086/379378 ID - Stephens2003 ER - TY - JOUR AU - Ackerman, H. AU - Usen, S. AU - Mott, R. AU - Richardson, A. AU - Sisay-Joof, F. AU - Katundu, P. AU - Taylor, T. AU - Ward, R. AU - Molyneux, M. AU - Pinder, M. AU - Kwiatkowski, D. P. PY - 2003 DA - 2003// TI - Haplotypic analysis of the TNF locus by association efficiency and entropy JO - Genome Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2003-4-4-r24 DO - 10.1186/gb-2003-4-4-r24 ID - Ackerman2003 ER - TY - STD TI - GMAP Website. [http://www.gmap.net/pub/003] UR - http://www.gmap.net/pub/003 ID - ref41 ER - TY - CHAP AU - Kirkwood, B. R. AU - Sterne, J. A. C. PY - 2003 DA - 2003// BT - Essential Medical Statistics ID - Kirkwood2003 ER -