TY - JOUR AU - Du, F. X. AU - Clutter, A. C. AU - Lohuis, M. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Characterizing linkage disequilibrium in pig populations JO - Int J Biol Sci VL - 3 UR - https://doi.org/10.7150/ijbs.3.166 DO - 10.7150/ijbs.3.166 ID - Du2007 ER - TY - JOUR AU - Solberg, T. R. AU - Sonesson, A. K. AU - Woolliams, J. A. AU - Meuwissen, T. H. E. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genomic selection using different marker types and densities JO - J Anim Sci VL - 86 UR - https://doi.org/10.2527/jas.2007-0010 DO - 10.2527/jas.2007-0010 ID - Solberg2008 ER - TY - JOUR AU - McKay, S. D. AU - Schnabel, R. D. AU - Murdoch, B. M. AU - Matukumalli, L. K. AU - Aerts, J. AU - Coppieters, W. AU - Crews, D. AU - Dias Neto, E. AU - Gill, C. A. AU - Gao, C. AU - Mannen, H. AU - Stothard, P. AU - Wang, Z. AU - Van Tassell, C. P. AU - Williams, J. L. AU - Taylor, J. F. AU - Moore, S. S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Whole genome linkage disequilibrium maps in cattle JO - BMC Genet VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2156-8-74 DO - 10.1186/1471-2156-8-74 ID - McKay2007 ER - TY - JOUR AU - Fahrenkrug, S. C. AU - Freking, B. A. AU - Smith, T. P. AU - Rohrer, G. A. AU - Keele, J. W. PY - 2002 DA - 2002// TI - Single nucleotide polymorphism (SNP) discovery in porcine expressed genes JO - Anim Genet VL - 33 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2052.2002.00846.x DO - 10.1046/j.1365-2052.2002.00846.x ID - Fahrenkrug2002 ER - TY - JOUR AU - Altshuler, D. AU - Pollara, V. J. AU - Cowles, C. R. AU - van Etten, W. J. AU - Baldwin, J. AU - Linton, L. AU - Lander, E. S. PY - 2000 DA - 2000// TI - An SNP map of the human genome generated by reduced representation shotgun sequencing JO - Nature VL - 407 UR - https://doi.org/10.1038/35035083 DO - 10.1038/35035083 ID - Altshuler2000 ER - TY - JOUR AU - van Tassell, C. P. AU - Smith, T. P. AU - Matukumalli, L. K. AU - Taylor, J. F. AU - Schnabel, R. D. AU - Lawley, C. T. AU - Haudenschild, C. D. AU - Moore, S. S. AU - Warren, W. C. AU - Sonstegard, T. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - SNP discovery and allele frequency estimation by deep sequencing of reduced representation libraries JO - Nat Methods VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth.1185 DO - 10.1038/nmeth.1185 ID - van Tassell2008 ER - TY - JOUR AU - Timko, M. P. AU - Rushton, P. J. AU - Laudeman, T. W. AU - Bokowiec, M. T. AU - Chipumuro, E. AU - Cheung, F. AU - Town, C. D. AU - Chen, X. PY - 2008 DA - 2008// TI - Sequencing and analysis of the gene-rich space of cowpea JO - BMC Genomics VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-103 DO - 10.1186/1471-2164-9-103 ID - Timko2008 ER - TY - JOUR AU - Meissner, A. AU - Gnirke, A. AU - Bell, G. W. AU - Ramsahoye, B. AU - Lander, E. S. AU - Jaenisch, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Reduced representation bisulfite sequencing for comparative high-resolution DNA methylation analysis JO - Nucleic Acids Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gki901 DO - 10.1093/nar/gki901 ID - Meissner2005 ER - TY - JOUR AU - Paterson, A. H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Leafing through the genomes of our major crop plants: strategies for capturing unique information JO - Nat Rev Genet VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nrg1806 DO - 10.1038/nrg1806 ID - Paterson2006 ER - TY - JOUR AU - Barbazuk, W. B. AU - Emrich, S. J. AU - Chen, H. D. AU - Li, L. AU - Schnable, P. S. PY - 2007 DA - 2007// TI - SNP discovery via 454 transcriptome sequencing JO - Plant J VL - 51 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2007.03193.x DO - 10.1111/j.1365-313X.2007.03193.x ID - Barbazuk2007 ER - TY - JOUR AU - Brockman, W. AU - Alvarez, P. AU - Young, S. AU - Garber, M. AU - Giannoukos, G. AU - Lee, W. L. AU - Russ, C. AU - Lander, E. S. AU - Nusbaum, C. AU - Jaffe, D. B. PY - 2008 DA - 2008// TI - Quality scores and SNP detection in sequencing-by-synthesis systems JO - Genome Res VL - 18 UR - https://doi.org/10.1101/gr.070227.107 DO - 10.1101/gr.070227.107 ID - Brockman2008 ER - TY - JOUR AU - McKay, S. D. AU - Schnabel, R. D. AU - Murdoch, B. M. AU - Aerts, J. AU - Gill, C. A. AU - Gao, C. AU - Li, C. AU - Matukumalli, L. K. AU - Stothard, P. AU - Wang, Z. AU - van Tassell, C. P. AU - Williams, J. L. AU - Taylor, J. F. AU - Moore, S. S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Construction of bovine whole-genome radiation hybrid and linkage maps using high-throughput genotyping JO - Anim Genet VL - 38 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2006.01564.x DO - 10.1111/j.1365-2052.2006.01564.x ID - McKay2007 ER - TY - JOUR AU - Ning, Z. AU - Cox, A. J. AU - Mullikin, J. C. PY - 2001 DA - 2001// TI - SSAHA: a fast search method for large DNA databases JO - Genome Res VL - 11 UR - https://doi.org/10.1101/gr.194201 DO - 10.1101/gr.194201 ID - Ning2001 ER - TY - JOUR AU - Wernersson, R. AU - Schierup, M. H. AU - Jørgensen, F. G. AU - Gorodkin, J. AU - Panitz, F. AU - Staerfeldt, H. H. AU - Christensen, O. F. AU - Mailund, T. AU - Hornshøj, H. AU - Klein, A. AU - Wang, J. AU - Liu, B. AU - Hu, S. AU - Dong, W. AU - Li, W. AU - Wong, G. K. AU - Yu, J. AU - Wang, J. AU - Bendixen, C. AU - Fredholm, M. AU - Brunak, S. AU - Yang, H. AU - Bolund, L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Pigs in sequence space: a 0.66× coverage pig genome survey based on shotgun sequencing JO - BMC Genomics VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-6-70 DO - 10.1186/1471-2164-6-70 ID - Wernersson2005 ER -