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Table 6 LA and microarray cluster comparison

From: Identification of gene co-expression clusters in liver tissues from multiple porcine populations with high and low backfat androstenone phenotype

Cluster 1

Cluster 2

#Cluster 1

#Cluster 2

Common genes

Pval

LA 1

LA Duroc Landrace 1

316

539

287

0.0000

LA 2

LA Duroc Landrace 5

134

90

87

0.0000

LA 3

LA Duroc Landrace 1

116

539

86

0.0000

LA 4

LA Duroc Landrace 3

96

150

76

0.0000

LA 6

LA Duroc Landrace 2

86

215

67

0.0000

LA 6

LA Duroc Landrace 4

86

90

5

0.0403

LA 7

LA Duroc Landrace 6

87

70

60

0.0000

LA 7

LA Duroc Landrace 7

87

55

5

0.0059

LA 8

LA Duroc Landrace 4

72

90

60

0.0000

LA 9

LA Duroc Landrace 1

68

539

55

0.0000

LA 11

LA Duroc Landrace 2

61

215

43

0.0000

LA 11

LA Duroc Landrace 7

61

55

9

0.0000

LA 12

LA Duroc Landrace 3

40

150

32

0.0000

LA 14

LA Duroc Landrace 9

39

39

18

0.0000

LA 17

LA Duroc Landrace 3

21

150

6

0.0001

LA 17

LA Duroc Landrace 7

21

55

13

0.0000

LA 19

LA Duroc Landrace 9

20

39

17

0.0000

LA 21

LA Duroc Landrace 12

21

25

20

0.0000

LA 25

LA Duroc Landrace 13

10

11

7

0.0000

LA 1

HA Duroc Landrace 2

316

256

148

0.0000

LA 2

HA Duroc Landrace 1

134

331

47

0.0000

LA 2

HA Duroc Landrace 5

134

51

28

0.0000

LA 2

HA Duroc Landrace 8

134

27

5

0.0016

LA 2

HA Duroc Landrace 9

134

15

5

0.0001

LA 3

HA Duroc Landrace 2

116

256

29

0.0000

LA 4

HA Duroc Landrace 1

96

331

29

0.0000

LA 4

HA Duroc Landrace 3

96

96

7

0.0070

LA 4

HA Duroc Landrace 5

96

51

6

0.0011

LA 6

HA Duroc Landrace 1

86

331

41

0.0000

LA 6

HA Duroc Landrace 6

86

44

6

0.0003

LA 6

HA Duroc Landrace 9

86

15

3

0.0034

LA 8

HA Duroc Landrace 1

72

331

35

0.0000

LA 9

HA Duroc Landrace 1

68

331

23

0.0000

LA 9

HA Duroc Landrace 3

68

96

6

0.0049

LA 14

HA Duroc Landrace 7

39

32

16

0.0000

LA 18

HA Duroc Landrace 7

28

32

6

0.0000

LA 21

HA Duroc Landrace 6

21

44

13

0.0000

  1. This table contains hypergeometric test results for LA cluster with microarray clusters.