| # | Assay name | RS | Exact test of population differentiation (P value) | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 |  |  |  | ASW | CEU | CHB | CHD | GIH | JPT | LWK | MEX | MKK | TSI | YRI |
drug transporters | Â | ATP-binding cassette | ||||||||||||
 | 1 | ABCB1_C3435ntT | rs1045642 | 0.00 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.07 + −0.00 | 0.06 + −0.0038 | 0.00 + −0.00 | 0.80 + −0.01 |  | 0.94 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.70 + −0.01 | 0.00 + −0.00 |
 | 2 | ABCB1_T1236ntC | rs1128503 | 0.00 + −0.00 | 0.08 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.25 + −0.01 | 0.35 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.39 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.06 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 | 3 | ABCB1_2677nt G > T | rs2032582 | 0.00 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.69 + −0.01 | 0.01 + −0.00 | 0.03 + −0.00 | 0.99 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.02 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.02 + −0.00 |  |
 | 4 | ABCC2_V417I | rs2273697 | 0.08 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.07 + −0.0057 | 0.13 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.40 + −0.01 | 0.14 + −0.00 | 0.26 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.02 + −0.00 |
 | 5 | ABCC2_I1324I | rs3740066 |  | 0.58 + −0.01 | 0.78 + −0.0050 |  |  | 0.69 + −0.01 |  |  |  |  | 0.82 + −0.00 |
 | 6 | ABCC2_-24C > T | rs717620 | 0.00 + −0.00 | 0.54 + −0.01 | 0.87 + −0.0056 | 0.67 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.55 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.41 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 1.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 | 7 | ABCG2_ 421 nt C > A | rs2231142 | 0.00 + −0.00 | 0.36 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |  | 0.35 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 |  | Solute carrier family 15 (H+/peptide transporter) | ||||||||||||
 | 8 | SLC15A2_P409S | rs1143671 | 0.04 + −0.00 | 0.09 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.03 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.67 + −0.01 |
 | 9 | SLC15A2_R509K | rs1143672 |  | 0.38 + −0.01 | 0.00 + −0.00 |  |  | 0.00 + −0.00 |  |  |  |  | 0.62 + −0.01 |
 | 10 | SLC15A2_A284A | rs2293616 | 0.11 + −0.01 | 0.19 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.08 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.09 + −0.0073 | 0.00 + −0.00 | 0.57 + −0.01 |
 | 11 | SLC15A2_L350F | rs2257212 | 0.04 + −0.00 | 0.09 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.05 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.67 + −0.01 |
 |  | Solute carrier family 22 (organic cation transporter) | ||||||||||||
 | 12 | SLC22A1_P283L | rs4646277 |  |  |  | 0.20 + −0.00 |  | 0.55 + −0.01 |  |  |  |  |  |
 | 13 | SLC22A1_P341L | rs2282143 | 0.82 + −0.00 | 0.04 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.11 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.12 + −0.01 | 0.63 + −0.00 | 0.70 + −0.00 |  | 0.03 + −0.00 |
 | 14 | SLC22A1_M408V | rs628031 | 0.47 + −0.01 | 0.17 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.26 + −0.01 | 0.91 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.09 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.07 + −0.00 | 0.61 + −0.01 | 0.02 + −0.00 |
 | 15 | SLC22A2_K432Q | rs8177517 | 1.00 + −0.00 | 0.37 + −0.00 | 0.60 + −0.01 |  |  | 0.61 + −0.0026 | 0.00 + −0.00 |  | 0.76 + −0.01 |  | 0.00 + −0.00 |
 | 16 | SLC22A2_M165I | rs8177507 | 1.00 + −0.00 | 0.29 + −0.00 | 0.47 + −0.00 |  |  | 1.00 + −0.00 |  | 0.67 + −0.01 |  |  | 0.37 + −0.01 |
 | 17 | SLC22A2*4.1_S270A | rs316019 | 0.00 + −0.00 | 0.21 + −0.01 | 0.09 + −0.01 | 0.26 + −0.00 | 0.02 + −0.00 | 0.16 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 1.00 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 |  | Solute carrier organic anion transporter family | ||||||||||||
 | 18 | SLCO1B1*1B_N130D | rs2306283 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.66 + −0.01 | 0.21 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 | 19 | SLCO1B1*5_V174A | rs4149056 | 0.01 + −0.00 | 0.26 + −0.01 | 0.54 + −0.01 | 0.70 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.39 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.16 + −0.01 | 0.28370 + −0.0066 | 0.08 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 | 20 | SLCO1B3_699G > A | rs7311358 |  | 0.01 + −0.00 | 0.93 + −0.00 |  |  | 0.12 + −0.02 |  |  |  |  | 0.00 + −0.00 |
 | 21 | SLCO1B3_334T > G | rs4149117 | 0.00 + −0.00 | 0.04 + −0.0020 | 0.28 + −0.01 | 0.84 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.13 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.06 + −0.0041 | 0.00 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 | 22 | SLCO2B1*3_S486F | rs2306168 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.13 + −0.00 | 0.06 + −0.00 | 0.23 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 1.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
phase II metabolizing enzymes | Â | Glutathione S-transferase pi 1 | ||||||||||||
 | 23 | GSTP1_V105I | rs1695 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.76 + −0.00 | 0.57 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.02 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 |  | N-acetyltransferase | ||||||||||||
 | 24 | NAT1*11A-C g.-344C > T | rs4986988 |  | 0.20 + −0.01 | 0.31 + −0.00 | 0.31 + −0.00 |  | 0.74 + −0.00 | 0.31 + −0.01 | 0.70 + −0.00 | 0.23 + −0.01 | 0.15 + −0.01 | 0.20 + −0.01 |
 | 25 | NAT1*14_560G > A | rs4986782 |  | 0.13 + −0.01 | 1.00 + −0.00 |  |  | 1.00 + −0.00 |  |  |  | 0.55 + −0.00 | 1.00 + −0.00 |
 | 26 | NAT2*5_341T > C | rs1801280 |  | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |  |  | 0.00 + −0.00 |  |  |  |  | 0.80 + −0.00 |
 | 27 | NAT2*6_590G > A | rs1799930 | 0.34 + −0.01 | 0.14 + −0.00 | 0.08 + −0.01 | 0.98 + −0.00 | 0.03 + −0.00 | 0.35 + −0.01 | 0.48 + −0.01 | 0.29 + −0.01 | 0.31 + −0.01 | 0.48 + −0.01 | 0.93 + −0.00 |
 | 28 | NAT2*7_857G > A | rs1799931 | 0.16 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.02 + −0.00 | 0.09 + −0.00 | 0.17 + −0.01 | 0.14 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.12 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 | 29 | NAT2*11_481C > T | rs1799929 | 0.89 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.13 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.04 + −0.00 | 0.12 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.02 + −0.00 |
 | 30 | NAT2*12_803A > G | rs1208 | 0.08 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.01 + −0.00 |
 | 31 | NAT2*13_282C > T | rs1041983 | 0.10 + −0.00 | 0.03 + −0.00 | 0.65 + −0.01 | 0.27 + −0.01 | 0.54 + −0.01 | 0.03 + −0.00 | 0.09 + −0.01 | 0.47 + −0.01 | 0.45 + −0.01 | 0.15 + −0.01 | 0.00 + −0.00 |
 |  | Thiopurine S-methyltransferase | ||||||||||||
 | 32 | TPMT*3C_719A > G C240Y | rs1142345 | 0.00 + −0.00 | 0.36 + −0.01 | 0.68 + −0.00 | 0.31 + −0.01 | 0.50 + −0.00 | 0.73 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.57 + −0.00 | 0.69 + −0.00 | 0.05 + −0.00 |
 |  | UDP glucuronosyltransferase | ||||||||||||
 | 33 | UGT1A1*6_211G > A | rs4148323 |  | 0.00 + −0.00 | 0.02 + −0.00 | 0.62 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.73 + −0.01 |  | 0.00 + −0.00 |  |  | 0.00 + −0.00 |
 | 34 | UGT2B7*2b_-327G > A | rs7662029 | 0.00 + −0.00 | 0.43 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.04 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.34 + −0.01 | 0.00 + −0.00 |
 | 35 | UGT1A1*60_-3263 T > G | rs4124874 | 0.00 + −0.00 | 0.35 + −0.01 | 0.01 + −0.00 | 0.30 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.18 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.05 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.87 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 | 36 | UGT2B7*2a_-161C > T | rs7668258 | 0.00 + −0.00 | 0.57 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.06 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.39 + −0.01 | 0.00 + −0.00 |
phase I metabolizing | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
enzymes | Â | Dihydropyrimidine dehydrogenase | ||||||||||||
 | 37 | DPYD*2A_IVS14 + 1G > A | rs3918290 |  |  |  |  | 0.04 + −0.00 |  |  |  |  |  |  |
 | 38 | DPYD*9A_C29R | rs1801265 | 0.00 + −0.00 | 0.86 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.02 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.02 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 |  | Cytochrome P450 | ||||||||||||
 | 39 | CYP1A1*2 g.2455A > G | rs1048943 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.08 + −0.01 | 0.07 + −0.01 | 0.07 + −0.00 | 0.28 + −0.01 |  | 0.05 + −0.00 |  | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 | 40 | CYP1A1*4 g.2453C > A | rs1799814 |  | 0.80 + −0.00 | 0.33 + −0.00 |  | 0.00 + −0.00 | 0.39 + −0.00 |  | 0.75 + −0.00 |  |  | 0.28 + −0.00 |
 | 41 | CYP1A2*1 F g.-163C > A | rs762551 | 0.67 + −0.00 | 0.31 + −0.01 | 0.63 + −0.01 | 0.39 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.25 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.20 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.60 + −0.01 | 0.05 + −0.01 |
 | 42 | CYP1A2*1 K g.-729C > T | rs12720461 |  |  |  |  | 0.40 + −0.00 |  |  |  |  |  |  |
 | 43 | CYP2A6*2 g.1799 T > A | rs1801272 |  | 0.05 + −0.00 | 0.60 + −0.00 |  |  | 0.62 + −0.00 |  |  |  |  | 0.37 + −0.00 |
 | 44 | CYP2B6*6 g.15631G > T | rs3745274 | 0.94 + −0.00 | 0.88 + −0.00 | 0.03 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.03 + −0.00 | 0.41 + −0.01 | 0.61 + −0.00 | 0.01 + −0.00 | 0.72 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |
 | 45 | CYP2B6*16 g. 21011 T > C | rs28399499 | 0.01 + −0.00 |  |  |  |  |  | 0.00 + −0.00 | 0.48 + −0.01 | 0.16 + −0.00 |  | 0.00 + −0.00 |
 | 46 | CYP2C8*2 g.11054A > T | rs11572103 |  | 1.00 + −0.00 | 1.00 + −0.00 |  |  | 1.00 + −0.00 |  |  |  |  | 0.00 + −0.00 |
 | 47 | CYP2C8*3 g.30411A > G | rs10509681 | 1.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 | 0.04 + −0.00 |  | 0.22 + −0.01 | 0.03 + −0.00 |  | 0.04 + −0.00 | 0.12 + −0.01 | 0.00 + −0.00 | 0.01 + −0.00 |
 | 48 | CYP2C8*4 g.11041C > G | rs1058930 |  |  |  |  | 0.69 + −0.00 |  |  |  |  |  |  |
 | 49 | CYP2C9*2 g.3608C > T | rs1799853 |  | 0.03 + −0.00 | 0.02 + −0.00 |  |  | 0.02 + −0.00 |  |  |  |  | 0.01 + −0.00 |
 | 50 | CYP2C9*3 g.42614A > C | rs1057910 | 0.08 + −0.01 | 0.42 + −0.01 | 0.37 + −0.01 | 0.39 + −0.01 | 0.02 + −0.00 | 0.02 + −0.00 |  | 0.51 + −0.00 |  | 0.72 + −0.01 | 0.00 + −0.00 |
 | 51 | CYP2C9*12 g.50338C > T | rs9332239 |  | 0.01 + −0.00 | 0.02 + −0.00 |  |  | 0.02 + −0.00 |  |  |  |  | 0.01 + −0.00 |
 | 52 | CYP2C19*2 g.19154G > A (splicing defect) | rs4244285 |  | 0.10 + −0.01 | 0.03 + −0.00 |  |  | 0.03 + −0.00 |  |  |  |  | 0.29 + −0.01 |
 | 53 | CYP2C19*2 g.80160C > T | rs3758580 |  | 0.40 + −0.01 | 0.01 + −0.00 |  |  | 0.05 + −0.00 |  |  |  |  | 0.58 + −0.00 |
 | 54 | CYP2C9*11 g.42542C > T | rs28371685 |  |  |  |  | 0.42 + −0.00 |  |  |  |  |  |  |
 | 55 | CYP2C19*17 g.-806C > T | rs12248560 |  | 0.00 + −0.00 | 0.04 + −0.00 |  |  | 0.00 + −0.00 |  |  |  |  | 0.00 + −0.00 |
drug targets | Â | Vitamin K epoxide reductase complex | ||||||||||||
 | 56 | VKORC1 | rs8050894 |  | 0.00 + −0.00 | 0.00 + −0.00 |  |  | 0.00 + −0.00 |  |  |  |  | 0.00 + −0.00 |