Skip to main content

Table 2 Type I error rates of 3 methods in scenarios 1 to 5

From: Indirect effect inference and application to GAW20 data

MAF

Method

Scenario

1

2

3

4

5

0.1

o-eSNP

0.000

0.003

0.028

0.025

0.048

LIPID

0.000

0.004

0.032

0.029

0.049

SNP

0.054

0.054

0.056

0.051

0.048

0.2

o-eSNP

0.000

0.007

0.039

0.024

0.053

LIPID

0.000

0.009

0.042

0.028

0.054

SNP

0.056

0.053

0.053

0.056

0.054

0.3

o-eSNP

0.000

0.009

0.041

0.027

0.050

LIPID

0.000

0.011

0.044

0.032

0.051

SNP

0.059

0.054

0.052

0.053

0.057

0.4

o-eSNP

0.000

0.011

0.043

0.021

0.048

LIPID

0.000

0.013

0.044

0.025

0.049

SNP

0.052

0.056

0.056

0.051

0.054

  1. The MAF changes from 0.1 to 0.4