From: Exploring the key genomic variation in monkeypox virus during the 2022 outbreak
Type | Region | Nucleotide Site | RS1 | RS5 | RS8 | RS9 | AA Site | RS1 | RS5 | RS8 | RS9 | Class |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ORF | J2L | 2626 | G | A | 54 | S | F | I | ||||
C9L | 32398 | G | A | 276 | L | I | ||||||
33084 | G | A | 48 | R | C | |||||||
C15L | 36486 | G | A | 78 | P | S | I | |||||
A47R | 152326 | C | T | 221 | H | Y | I | |||||
J1L | 1298 | G | A | 105 | S | L | II | |||||
D9L | 14058 | G | T | 423 | A | D | II | |||||
C3L | 27697 | G | A | 36 | S | F | II | |||||
C18L | 39229 | G | A | 611 | F | II | ||||||
40387 | G | A | 225 | I | ||||||||
40689 | C | T | 125 | E | K | |||||||
C19L | 41146 | C | T | 359 | E | II | ||||||
41166 | C | T | 353 | E | K | |||||||
F8L | 55158 | G | A | 518 | V | II | ||||||
56390 | G | A | 108 | L | F | |||||||
F9R | 56908 | G | A | 56 | D | N | II | |||||
G9R | 75339 | C | T | 30 | S | L | II | |||||
75512 | G | A | 88 | D | N | |||||||
G10R | 76478 | G | A | 142 | M | I | II | |||||
M4R | 79656 | G | A | 162 | E | K | II | |||||
A19R | 126413 | G | A | 62 | E | K | II | |||||
126957 | G | A | 243 | R | Q | |||||||
127532 | G | A | A | 435 | E | K | K | |||||
A24R | 130359 | G | A | A | 100 | D | N | N | II | |||
130981 | C | T | 307 | S | L | |||||||
B21R | 181670 | G | A | 209 | D | N | II | |||||
183209 | C | T | 722 | P | S | |||||||
186265 | G | A | 1740 | M | I | |||||||
J2R | 194233 | C | T | 54 | S | F | II | |||||
J3R | 195561 | C | T | 105 | S | L | II | |||||
J3L | 3147 | G | A | 498 | I | a | a | a | III | |||
3558 | G | A | 361 | I | ||||||||
3854 | C | T | 263 | D | ||||||||
D3R | 7747 | C | T | 64 | I | III | ||||||
O1L | 23728 | G | A | 237 | F | III | ||||||
C1L b | 25599 | C | T | T | 185 | S | III | |||||
I7L | 66571 | G | A | 140 | I | III | ||||||
G8L b | 74635 | C | T | T | 196 | D | N | N | III | |||
L6R b | 83548 | G | A | 50 | K | III | ||||||
84646 | C | T | 356 | N | ||||||||
84724 | G | A | 442 | T | ||||||||
85599 | C | T | T | 734 | S | L | L | |||||
86860 | C | T | 1154 | F | ||||||||
H4L b | 89503 | G | A | A | 740 | H | Y | Y | III | |||
89570 | G | A | A | 717 | F | |||||||
E3R | 97316 | G | A | 125 | V | III | ||||||
A11L b | 121579 | C | T | T | 98 | D | N | N | III | |||
A14L b | 123603 | C | T | T | 17 | A | T | T | III | |||
A45L b | 150269 | G | A | A | 328 | I | III | |||||
B5R b | 164557 | C | T | T | 500 | L | III | |||||
B9R b | 167383 | G | T | T | 108 | R | I | I | III | |||
167847 | C | T | T | 263 | L | F | F | |||||
B11R | 169968 | G | A | 75 | R | III | ||||||
J1R | 193005 | G | A | 263 | D | a | a | a | III | |||
193301 | C | T | 361 | I | ||||||||
193712 | C | T | 498 | I | ||||||||
B14R | 172992-172993 | Add | (AT)34 | (AT)34 | (AT) 18 | a | a | a | III | |||
NCR | 15486 | G | A | II | ||||||||
153420 | A | C | II | |||||||||
157756 | G | A | II | |||||||||
177827 | G | A | II | |||||||||
135368-135369 | Add | (T)19 | (T)18 | (T) 17 | II | |||||||
94010b | G | A | A | III | ||||||||
187115b | C | T | T | III | ||||||||
178879-178896b (TATATACAT)2 | Del | ✓ | ✓ | III |